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『SMILES記法』より : SMILES記法(すまいるすきほう、Simplified molecular input line entry specification syntax)とは、分子の化学構造をASCII符号の英数字で文字列化した構造の曖昧性の無い表記方法である。SMILES文字列は多くの種類の分子エディタににおいてインポート可能で、二次元の図表あるいは三次元のモデルとして表示することができる。
SMILES表記は1980年代の終わりにDavid Weiningerにより開発され、その後に多数の人の手で変更あるいは拡張がなされてきた。中でもDaylight Chemical Information Systems社の貢献が大きい。他の線形な同様な表記法としてはWiswesser Line Notation (WLN), ROSDAL そして SLN (Tripos社)が挙げられる。
SMILESはグラフ理論に基づいたコンピュータ処理に付けられた用語で、化学構造を表すグラフ構造で3つの方向に伸びるグラフ(枝、あるいは結合)と各分岐点(節、あるいは原子)を印刷可能な符号を割り当てることで、化学構造を文字列で表したコードである。化学構造グラフは、最初に目的の構造の水素原子のついた枝(結合)を取り払い、環を形成してるところは切り開いてグラフをグラフ理論でいうところのスパニング木(spanning tree)に変換する。環を開いたところは、番号の前置辞でラベル付けして、連結されていた節同士を明示している。角括弧(Bracket)は木構造が分枝している場所を表すのに使用する。
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『SMILES記法』より : SMILES記法(すまいるすきほう、Simplified molecular input line entry specification syntax)とは、分子の化学構造をASCII符号の英数字で文字列化した構造の曖昧性の無い表記方法である。SMILES文字列は多くの種類の分子エディタににおいてインポート可能で、二次元の図表あるいは三次元のモデルとして表示することができる。
SMILES表記は1980年代の終わりにDavid Weiningerにより開発され、その後に多数の人の手で変更あるいは拡張がなされてきた。中でもDaylight Chemical Information Systems社の貢献が大きい。他の線形な同様な表記法としてはWiswesser Line Notation (WLN), ROSDAL そして SLN (Tripos社)が挙げられる。
SMILESはグラフ理論に基づいたコンピュータ処理に付けられた用語で、化学構造を表すグラフ構造で3つの方向に伸びるグラフ(枝、あるいは結合)と各分岐点(節、あるいは原子)を印刷可能な符号を割り当てることで、化学構造を文字列で表したコードである。化学構造グラフは、最初に目的の構造の水素原子のついた枝(結合)を取り払い、環を形成してるところは切り開いてグラフをグラフ理論でいうところのスパニング木(spanning tree)に変換する。環を開いたところは、番号の前置辞でラベル付けして、連結されていた節同士を明示している。角括弧(Bracket)は木構造が分枝している場所を表すのに使用する。
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